Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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