Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

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Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwa3bJ9JI28 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms