Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm379J3QQ19 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms