Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer2J3QPU5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms