Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC024978J3QPC3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC024978J3QPC3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC024978J3QPC3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms