Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms