Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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