Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm21976J3QNN2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm21976J3QNN2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm21976J3QNN2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm21976J3QNN2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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