Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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E030018B13RikJ3QMS9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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E030018B13RikJ3QMS9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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E030018B13RikJ3QMS9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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E030018B13RikJ3QMS9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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E030018B13RikJ3QMS9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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