Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Gm20834J3QM72 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20834J3QM72 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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