Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm17535J3KMR8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm17535J3KMR8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm17535J3KMR8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm17535J3KMR8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm17535J3KMR8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17535J3KMR8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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