Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ScaperF8VQ70 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms