Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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