Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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