Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms