Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Krt78E9Q0F0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Krt78E9Q0F0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Krt78E9Q0F0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Krt78E9Q0F0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Krt78E9Q0F0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Krt78E9Q0F0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Krt78E9Q0F0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Krt78E9Q0F0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt78E9Q0F0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Krt78E9Q0F0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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