Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms