Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh8D3Z6W3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms