Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms