Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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