Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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