Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms