Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Syce3B5KM66 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Syce3B5KM66 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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