Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Phf11bB4XVQ1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Phf11bB4XVQ1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms