Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm7714-201ENSMUST00000169154 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apba1B2RUJ5 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms