Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt4B2RU40 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms