Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms