Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scml2B1AVB3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms