Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Trabd2bB1ATG9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Trabd2bB1ATG9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms