Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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