Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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