Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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