Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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