Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms