Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms