Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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