Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms