Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Pramef6A2A8M8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pramef6A2A8M8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pramef6A2A8M8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pramef6A2A8M8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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