Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PtprfA2A8L5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms