Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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