Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms