Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms