Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms