Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd2V9GX34 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms