Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms