Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms