Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Clip2Q9Z0H8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Clip2Q9Z0H8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Clip2Q9Z0H8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Clip2Q9Z0H8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms