Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme3Q9WV85 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms