Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec2Q9WV35 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec2Q9WV35 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec2Q9WV35 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec2Q9WV35 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec2Q9WV35 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms