Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnip1Q9WUU8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms